財政部高雄國稅局表示：稅捐稽徵法第48條之1第2項於103年6月4日公布新增，有關營利事業應保存憑證而未保存，如已給與或取得憑證且帳簿記載明確，不涉及逃漏稅捐，於稅捐稽徵機關裁處，或行政救濟程序終結前，提出原始憑證、或取得與原應保存憑證相當之證明者，免依稅捐稽徵法第44條規定處罰；其涉及刑事責任者，並得免除其刑。

國稅局進一步說明，為了讓營利事業據實開立、取得並保存憑證，使得營利事業課徵資料能夠確實保存，建立公平的課稅憑證制度，稅捐稽徵法第44條規定如未依法保存營利事業憑證者，課處查明後總額百分之五的罰鍰。但依照司法院釋字第642號解釋意旨：「如果營利事業確實已給與或取得憑證，且帳簿記載明確，那麼在稅捐稽徵機關進行裁處、或者在法院救濟程序終結前，營利事業能夠提出相關憑證證明者，應予以免罰，據以落實憲法第15條保障人民財產權及第23條比例原則。」故增訂稅捐稽徵法第48條之1第2項。